一般而言，除了抽烟者，有些车主对天窗的使用率很低，甚至很多车主都对天窗缺少关怀，长期不进行保养，就容易出现老化等状况。要知道，任何一件东西，长时间不使用就容易出现各种问题。每次保养，都提醒师傅检查一下天窗是个必要举措。
长期不保养天窗可能会漏水。汽车天窗即使关闭得很紧，但下雨天还会渗水，这是由于天窗的密封圈在使用中会逐渐老化，导致天窗漏水。天窗在保养后会发生密封胶条“被掀起”的移位，这是由于胶条和车顶之间的摩擦力过大造成的。可以选用滑石粉定期润滑，在保持密封性的基础上降低多余的摩擦力。
一旦漏水要立即进店修复。天窗出现漏水有多方面的原因。一个是排水系统出了问题，天窗处有一个凹坑，如果排水不好的话就会流入车内。造成漏水的原因主要是A柱里的两根排水管，比如密封接合面的橡胶老化或者破损后造成漏水。此外，天窗排水口一般比较隐秘，车型不同位置也不同，正常保养4S店专业人员也比较容易忽视。如果天窗漏水了，要检查一下排水口是否被灰尘堵塞。汽车天窗日常保养没有特殊要求，只需定期检查天窗周边密封条是否有破损，并检查轨道润滑状况。
专家提醒：如果出现天窗漏水，建议到4S店修理厂让维修师傅拿水浇灌天窗试一下，找到漏水点再进行修复。另外一个原因是车辆发生碰撞事故造成漏水，这很有可能使车辆的车身尺度校正不到位，这种情况下也需要重新校正修复。
天窗关不严也会出问题。频繁使用天窗后就会发现，天窗有时候关不严，这是由于车主们不经常给天窗做保养所攒下的小毛病。因为天窗设计是有防挤压的功能，所以在天窗轨道有灰尘受阻的情况下就会出现关不上的问题，因此这就是车主们要经常擦拭轨道里的灰尘的原因。如果遇到天窗关不严的情况，车主们可以让天窗后头先翘起，翘起后按住开关不放1分钟后，这样天窗又会翘起一部分，一会儿天窗就会完全关上了。
专家提醒：在极为颠簸的道路上最好不要完全滑开天窗，否则可能因天窗和滑轨之间振动太大而引起相关部件变形甚至使电机损坏。有很多天窗发生的故障都是使用者的人为因素造成的，比如手动式天窗的锁扣或摇柄不慎拧反了方向对天窗造成损害。